人工保洁船结构简单、价格低廉，适合乡村河道等浅窄水域；中型机械保洁船配备输送带和储存舱，是目前应用最广泛的类型；大型专业保洁船自动化程度高、作业能力强，适用于大江大河和大型湖泊。
从地域分布看，保洁船的应用与经济发展水平和水环境治理需求密切相关。长三角、珠三角等经济发达地区以及重点旅游城市，保洁船的普及率较高；而在经济欠发达地区，人工打捞仍占主导。这种分布反映出保洁船推广受制于资金投入的现实。
尽管保洁船的应用取得了显著进展，但仍存在一些问题。首先是产品同质化严重，不同厂家的产品往往大同小异，缺乏针对特定场景的优化设计；其次是售后服务不完善，保洁船属于专业设备，维修、保养需要专业知识，但很多地区缺乏相应的技术支持；再次是操作人员培训不足，导致设备使用效率低下或不当操作引发故障。
解决这些问题需要多方共同努力。产品制造企业应加强研发，针对不同水域特点开发差异化产品；政府部门可出台扶持政策，对购买保洁船的单位给予补贴，并建立区域性维修保养中心；行业协会应组织操作培训，提高从业人员技能水平。
保洁船的应用不仅提高了清洁效率，还带动了相关产业发展。围绕保洁船的制造、销售、租赁、维修、培训等环节，已经形成了初步的产业链。随着水环境保护要求不断提高，保洁船市场还将进一步扩大。
